Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms