Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brsk1Q5RJI5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk1Q5RJI5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk1Q5RJI5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms