Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna2d4Q5RJF7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms