Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms