Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtp3Q5QGU6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms