Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RilpQ5ND29 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms