Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf1Q5ND28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms