Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810065E05RikQ5NC41 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
1810065E05RikQ5NC41 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms