Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CoblQ5NBX1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CoblQ5NBX1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms