Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps41Q5KU39 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps41Q5KU39 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms