Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ecm2Q5FW85 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms