Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8bQ5DU41 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc8bQ5DU41 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms