Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1lQ5D525 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms