Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp13Q5BKP2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms