Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
L1td1Q587J6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms