Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccnl1Q52KE7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccnl1Q52KE7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnl1Q52KE7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms