Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtmr11Q3V1L6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr11Q3V1L6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mtmr11Q3V1L6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr11Q3V1L6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr11Q3V1L6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr11Q3V1L6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr11Q3V1L6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr11Q3V1L6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms