Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd5Q3V1H9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms