Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ckap2Q3V1H1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckap2Q3V1H1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms