Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ulk4Q3V129 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ulk4Q3V129 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 941 ms