Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Garnl3Q3V0G7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Garnl3Q3V0G7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms