Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc55Q3UY51 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms