Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms