Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q3UPC7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UPC7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Q3UPC7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UPC7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UPC7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UPC7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UPC7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UPC7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms