Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms