Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem241Q3UME2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms