Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc4Q3UMB9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc4Q3UMB9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms