Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc61Q3UJV1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc61Q3UJV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms