Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q3UJC8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q3UJC8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q3UJC8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q3UJC8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q3UJC8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q3UJC8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q3UJC8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q3UJC8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q3UJC8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q3UJC8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q3UJC8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q3UJC8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q3UJC8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms