Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms