Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnep1r1Q3UJ81 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnep1r1Q3UJ81 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms