Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6cQ3UHC0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6cQ3UHC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms