Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsph3aQ3UFY4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph3aQ3UFY4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms