Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam35aQ3UEN2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam35aQ3UEN2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms