Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Puf60Q3UEB3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Puf60Q3UEB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Puf60Q3UEB3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms