Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttll12Q3UDE2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll12Q3UDE2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll12Q3UDE2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms