Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cops9Q3U898 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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