Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssbp4Q3U4B1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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