Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms