Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hvcn1Q3U2S8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hvcn1Q3U2S8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms