Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serac1Q3U213 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serac1Q3U213 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms