Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tatdn3Q3U1C6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tatdn3Q3U1C6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tatdn3Q3U1C6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms