Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palb2Q3U0P1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms