Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc9Q3U0M1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms