Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hace1Q3U0D9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hace1Q3U0D9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms