Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ87

March9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March9Q3TZ87 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
March9Q3TZ87 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
March9Q3TZ87 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
March9Q3TZ87 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
March9Q3TZ87 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.32■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March9Q3TZ87 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March9Q3TZ87 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
March9Q3TZ87 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March9Q3TZ87 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March9Q3TZ87 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms