Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lmtk2Q3TYD6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lmtk2Q3TYD6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmtk2Q3TYD6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Lmtk2Q3TYD6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmtk2Q3TYD6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmtk2Q3TYD6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmtk2Q3TYD6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms