Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt1Q3TX08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt1Q3TX08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms