Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tamm41Q3TUH1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tamm41Q3TUH1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tamm41Q3TUH1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tamm41Q3TUH1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tamm41Q3TUH1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tamm41Q3TUH1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tamm41Q3TUH1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tamm41Q3TUH1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tamm41Q3TUH1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tamm41Q3TUH1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms