Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp4cQ3TKR3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4cQ3TKR3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms