Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms